Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERVV-1B6SEH8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms