Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TMOD3Q9NYL9 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TMOD3Q9NYL9 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms