Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LTBP3Q9NS15 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms