Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SNX29Q8TEQ0 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms