Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
C9orf135Q5VTT2 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms