Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CDO1Q16878 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CDO1Q16878 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CDO1Q16878 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDO1Q16878 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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