Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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