Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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