Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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