Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms