Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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