Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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UBE4AQ14139 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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UBE4AQ14139 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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