Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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