Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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