Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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