Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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SKP2Q13309 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SKP2Q13309 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SKP2Q13309 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SKP2Q13309 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKP2Q13309 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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