Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms