Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARID4AP29374 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms