Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPREP23469 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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