Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM35Q9UPQ4 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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