Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms