Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms