Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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