Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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