Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms