Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms