Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PDCD1Q15116 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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