Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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