Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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