Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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