Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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NCOA4Q13772 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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NCOA4Q13772 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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