Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms