Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXF2Q12947 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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