Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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