Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPREP23469 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms