Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CRXO43186 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CRXO43186 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CRXO43186 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CRXO43186 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CRXO43186 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CRXO43186 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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