Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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BRPF3Q9ULD4 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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BRPF3Q9ULD4 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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BRPF3Q9ULD4 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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