Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.58□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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C9orf135Q5VTT2 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C9orf135Q5VTT2 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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