Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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