Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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