Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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SYCP1Q15431 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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