Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms