Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PTPRRQ15256 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
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PTPRRQ15256 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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PTPRRQ15256 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRRQ15256 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRRQ15256 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRRQ15256 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRRQ15256 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRRQ15256 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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