Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL4BQ13620 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CUL4BQ13620 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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