Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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MKRN4PQ13434 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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MKRN4PQ13434 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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MKRN4PQ13434 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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MKRN4PQ13434 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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