Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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TCOF1Q13428 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TCOF1Q13428 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TCOF1Q13428 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TCOF1Q13428 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TCOF1Q13428 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.59□□□□□ -2
TCOF1Q13428 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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