Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ITGB3BPQ13352 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ITGB3BPQ13352 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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