Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms