Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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