Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms